在準備注冊運輸公司時，企業主需準備以下材料：

1. 公司名稱預先核準通知書：在工商局進行公司名稱核準，取得核準通知書。

2. 公司章程：根據公司的經營范圍和股東結構編制公司章程。

3. 法定代表人身份證明：提供法定代表人的身份證明及個人信息。

4. 公司注冊地址證明：如租賃合同或房產證復印件。

5. 股東身份證明：股東的身份證明材料。

6. 銀行開戶許可證：公司注冊時需要開設企業銀行賬戶并提供相關開戶許可證。

這些材料是完成注冊運輸公司手續的基礎，確保每項材料都齊全有助于注冊順利進行。