公司減少注冊資本的程序并非簡單的資本減少操作，需要經過多個法律程序。具體步驟如下：

1. 股東會決議：首先，企業需召開股東會，經過股東表決通過減少注冊資本的決議。根據公司法規定，股東會決議必須經過三分之二以上的股東同意。此步驟需要保證決議程序的合規性，避免未來的法律風險。

2. 公告和公示：根據相關法律規定，減資決定通過后，公司需要在企業所在地的報紙上進行公告。公告期一般為45天，目的是告知社會公眾，尤其是債權人，以便其提出異議或要求清償。

3. 債務清償：公司在減少注冊資本時需要確保所有債務得到妥善處理。公司必須清償或與債權人達成協議，確保債權人權益不受侵害。如果公司未能清償債務，減資程序將受到限制。

4. 向工商行政管理部門提交申請：公告期滿后，公司需要向當地工商局提交減資申請，并提供相關資料，包括股東會決議、債權債務清單等。

5. 工商核準和登記：工商行政管理部門會根據提交的申請進行審核，若審核通過，則會核準公司減資，并更新公司注冊資本。此時，公司需要領取新的營業執照，注冊資本變更完成。

整個程序下來，減少注冊資本的操作通常需要2-3個月的時間，但這也會因地區和具體情況的不同而有所差異。